Dynabeads Q&A
1. Dynabeads 및 Dynamag 2. Protein A/G beads 및 IP, Co-IP 3. Streptavidin beads	IP-kit home Additional Information Troubleshooting guide Tech Tip
Dynabesd 및 Dynamag
Q. Dynabeads가 뭔가요? A. Dynabeads는 Invetrogen에서 출시되고 있는 magnetic bead입니다. 겉이 매끈한 polystyrene으로 되어있으며, beads 내부에는 gamma-Fe2O3와 Fe3O4로 이루어져 있습니다. Dynabeads는 supeparamagnetic bead이기 때문에 beads만 있을 경우엔 자기장을 가지지 않습니다. 또한 magnetic material이 여러 겹의 껍질로 둘러 싸여있기 때문에 target molecule이 자성에 영향을 받지 않게 됩니다.
Q. Dynamag의 자석 종류는 무엇인가요? A. DynaMag는 자석 종류 중 가장 자성이 강한 Neodymium자석입니다. 자성이 강하기 때문에 bead를 짧은 시간에 효과적으로 끌어당겨 실험 시간을 단축시켜줘서 target molecule에 큰 영향 없이 purification할 수 있게 도와줍니다.
Q. Dynamag에는 어떤 종류들이 있나요? A. 1.5ml tube용으로는 DynaMag-2 (12321D)와 DynaMag-spin (12320D)이 있으며 blood collection tube나 flow tube용으로 나오는 DynaMag-5, 15ml tube용의 DynaMag-15, 50ml tube용의 DynaMag-50 등이 있습니다.
Q. DynaMag-2와 DynaMag-spin의 차이점이 뭔가요? A. DynaMag-2와 DynaMag-spin은 두 제품 모두 1.5ml tube용이라는 공통점이 있습니다. 그러나 DynaMag-2 같은 경우에는 총 16개, DynaMag-spin은 총 6개의 tube가 들어간다는 차이점이 있습니다. 또한 DynaMag-2는 일반적인 sample lock처럼 바닥에 수직한 방법으로 tube가 고정되는 것에 비해서 DynaMag-spin은 약간 사선으로 tube가 꽂히는 방식이기 때문에 적은 양의 sample로 실험을 하실 때 효과적이라는 장점이 있습니다.
Protein A/G beads 및 IP, Co-IP
Q. Dynabeads Protein A와 Dynabeads Protein G의 차이점은 뭔가요? A. Dynabeads Protein G와 Dynabeads protein A는 protein G와 recombinant protein A가 공유결합 되어있는 2.8 micron beads입니다. Protein G와 A는 다른 종과 subclass의 immunoglobulin에 결합 세기에 차이를 보입니다. 자세한 사항은 selection guide를 참고하세요 (http://www.invitrogen.com/site/us/en/home/Products-and-Services/Applications/Protein-Expression-and-Analysis/Protein-Sample-Preparation-and-Protein-Purification/ProteinSPProteinIso-Misc/Protein-Isolation/Immunoprecipitation-using-Dynabeads-Protein-A-or-Protein-G.html)
Q. Dynabeads로 IP실험을 수행할 수 있습니까? A. IP실험이 가능합니다. Antibody coupling kit, Co-IP kit, pre-coated in sheep anti-mouse IgG (mouse 1’ antibody와 함께 사용), pre-coated in sheep anti-rabbit IgG (rabbit 1’ antibody와 함께 사용)등이 있습니다. 자세한 사항은 selection guide를 참고해주세요. (http://kr.invitrogen.com/site/kr/ko/home/Products-and-Services/Applications/Protein-Expression-and-Analysis/Protein-Sample-Preparation-and-Protein-Purification/ProteinSPProteinIso-Misc/Protein-Isolation/Immunoprecipitation-using-Dynabeads-Protein-A-or-Protein-G.html)
Q. 4.5 micron large beads를 IP 실험에 사용할 수 있습니까? A. 네, 사용 가능합니다. Dynabeads anti-rat (Cat# 11035)의 경우 rat origin 1’ antibody를 이용하여 사용할 수 있습니다. 그렇지만 작은 beads들의 표면적이 더 넓기 때문에 더 높은 yield율을 보입니다.
Q. IP kit과 Co-IP kit의 차이는 뭔가요? A. 두 kit들은 beads와 kit내부에 들어있는 구성 buffer에서 큰 차이를 보입니다. 일단 IP kit에는 일반적으로 잘 알고 계시는 Dynabeads protein A 또는 protein G가 들어있습니다. 반면 Co-IP kit에는 M-280 Epoxy beads가 들어있는데요, M-280 Epoxy beads는 antibody와 공유결합을 통해 binding하기 때문에 elution 후에도 antibody가 beads와 떨어지지 않는다는 장점을 가지고 있습니다. 만약 확인하시고자 하는 molecule의 size가 antibody의 heavy/light chain과 비슷한 size라면 (50kDa/25kDa) Co-IP kit을 사용하시는 것이 훨씬 실험에 유리합니다. 또한 Co-IP kit에는 beads activation buffer를 포함한 다양한 buffer들이 들어있는 것에 비해서 IP Kit에는 antibody binding-washing buffer와 washing buffer가 들어있다는 것이 차이점입니다.
Q. Kit에 들어있는 buffer를 따로 구매할 수 있나요? A. Kit 내부에 들어있는 buffer는 따로 구매가 어렵습니다.
Streptavidin beads
Q. Biotinylated molecule을 잡고 싶어요 A. Dynalbeads 제품 중 beads 표면에 Streptavidin이 coating 되어있는 제품이 있습니다. 만일 biotinylated molecule을 잡고 싶으시다면 Streptavidin beads를 사용하시는 것이 좋습니다. Streptavidin beads는 beads의 크기나 특징에 따라서 총 네 가지 beads가 있습니다. Hydrophobic한 성질을 가지는 M-280과 MyOne T1 beads는 주로 protein target에 적절하며 hydrophilic한 성질을 가지는 M-270과 MyOne C1 beads는 DNA/RNA work에 더 적합합니다. 자세한 사항은 홈페이지 내용을 참고해주세요. (http://kr.invitrogen.com/site/kr/ko/home/brands/Product-Brand/Dynal/Streptavidin-Coupled-Dynabeads.html?icid=fr-dynabeads-4)
Q. Biotinylated molecule을 잡고 싶은데 어떤 beads가 적절한지 잘 모르겠어요 A. Dynabeads Streptavidin Trila Kit을 추천해 드립니다. 이 제품에는 Streptavidin MyOne C1, Myone T1, M-270, M-280 beads가 각 1ml씩 들어있는 제품이기 때문에 하시려는 실험에 어떤 beads가 가장 적당한지 알아볼 수 있다는 장점이 있습니다.
Q. 길이가 긴 biotinylated DNA를 잡고 싶은데요. A. Kilobase BINDER kit (60101) 제품을 추천해 드립니다. 이 제품은 2kb 이상의 biotinylated DNA나 RNA fragment를 잡을 수 있는 제품입니다. 이 kit에는 M-280 beads와 함께 binding buffer가 들어있는데요, 이 binding buffer에 의해서 길이가 긴 fragment도 효과적으로 capture할 수 있습니다.
Q. Kit에 들어있는 buffer를 따로 구매할 수 있나요? A. Kit 내부에 들어있는 buffer는 따로 구매가 어렵습니다.
Q. Biotinylated antibody를 이용해서 cell isolation 한 후에 flow-cytometry 실험을 하고 싶습니다. A. CELLection Biotin Binder Kit (Cat# 11533D) 제품을 추천해 드립니다. 해당 제품은 beads와 antibody가 DNA linker로 연결되기 때문에 DNA liker를 끊어주는 buffer를 이용해서 beads와 cell을 손쉽게 분리할 수 있는 특징이 있습니다. 만일 isolation한 cell과 beads가 binding되어있어도 상관 없는 실험을 진행하실 경우에는 Dynabeads Biotin Binder (Cat# 11047) 제품을 사용하실 것을 추천해 드립니다.
학술 마케팅팀: 한소영  techserv@woongbee.com Tel. 031-776-3300 (내선 122) / Fax. 031-776-3303